Das Archiv der Gedenkstätte und des Museums enthält Dokumente, Zeitungen, Photos, Dias und Videoaufnahmen zu folgenden Themen:

1. Erste Republik, Bürgerkrieg, Ständestaat:
Exekutiv-Dokumente (Ebensee, Bad Ischl)
Gemeinderatsprotokolle Ebensee
Umfangreiche Sammlung zum Jahr 1934
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2. Nationalsozialismus:
Juden im Salzkammergut, Arisierungsakten
Regionale Dokumente (SA, Gemeinde-korrespondenz Ebensee, Bad Ischl)
Zeitdokumente (Bücher, Hefte, Zeitungen, Abzeichen…)
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3. KZ-Ebensee:
Listen von Überlebenden und Toten
Transportlisten
Dokumente aus dem KZ-Ebensee
Häftlingsnachlässe
Zwangsarbeiter in Ebensee
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4. Widerstand:
Flugblätter
Anzeigen
Dossiers
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5. Nachkriegszeit:
Entnazifizierung
Zeitzeugenberichte
Kriegsopfer in Ebensee
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6. Gedenkkultur:
Inländische und ausländische Gedenkstätten
Gedenkstätte und Zeitgeschichte Museum Ebensee
Projekte
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7. Zeitschriften:
Historische Tageszeitungen
Politische Zeitschriften
Antifaschistische Zeitschriften
Zeitschriften von Überlebendenorganisationen
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8. Fotos, Medien:
Regionalgeschichte 1918-1938: Ebensee
Regionalgeschichte 1918-1945: Bad Ischl
Arbeiterbewegung
Februar 1934
NS-Zeit in Ebensee
Widerstand im Salzkammergut
KZ-Ebensee
Diverses zur Geschichte aus dem Salzkammergut
Diverses zur Geschichte Österreichs
KZ-Gedenkstätte Ebensee

CDs, DVDs, Videos und Kassetten
Zeitungsarchiv
Weiters führt das Museum seit 1989 ein Zeitungsarchiv, in dem Artikel aus österreichischen und teils deutschen Tages- und Wochenzeitungen und Zeitschriften zu folgenden Themenbereichen gesammelt werden:

- Antisemitismus/ Judentum
- Ausländer/ Minderheiten/ Rassismus
- Nationalsozialismus
- Rechtsextremismus
- Vergangenheitsbewältigung
- Zeitgeschichte Museum + KZ-Gedenkstätte
- Salzkammergut